三峽校區學生會是三峽校區的行政機關，依據《國立臺北大學學生自治會組織章程》及《大專校院學生會運作原則》等規定，代表三峽校區學生進行施政，在校級會議代表學生的利益發聲，辦理並支持各種活動、學術，也負責特約商店的簽約及生理用品共享盒的提供。

學生會由經三峽校區學生每年選舉產生的學生會長領導，並由其內閣成員協助各類行政事務。

學生會同時也辦理社團博覽會、社團活動大型補助及協助學生申訴的業務。